O Conselho Universitário (CONSUNI) é o órgão máximo da UFFS com função normativa, deliberativa e recursal, responsável pela formulação da política geral da Instituição nas dimensões acadêmica, administrativa, financeira, patrimonial e disciplinar.   

O CONSUNI tem sua composição e competências definidas pelo Estatuto da UFFS, é regulado pelo Regimento Geral da UFFS e disciplinado por seu Regimento Interno.  

 O mandato dos membros do Conselho Universitário é de dois anos, admitida uma recondução subsequente, exceto o mandato dos membros natos, que atuam no Conselho de forma concomitante ao exercício do cargo.   O mandato atual tem vigência de 1º de setembro de 2023 a 31 de agosto de 2025.