Os estudantes e docentes do curso dispõem da seguinte infraestrutura:     

Biblioteca  

 Atualmente a UFFS dispõe de seis bibliotecas, uma em cada Campus. Os serviços oferecidos são: consulta ao acervo; empréstimo, reserva, renovação e devolução; empréstimo entre bibliotecas; empréstimos de notebooks; acesso à internet wireless; comutação bibliográfica; orientação sobre normalização de trabalhos; catalogação na fonte; serviço de alerta; visita guiada; serviço de disseminação seletiva da informação; divulgação de novas aquisições; capacitação no uso dos recursos de informação; teleatendimento; serviço de referência online; serviço de geração de ficha de identificação da obra.  

 O acervo de Laranjeiras do Sul conta com mais de 5.700 títulos, que somam mais de 17.500 exemplares. Além disto, a UFFS possui o "Minha Biblioteca" que contém mais de 15.100 títulos em E-Book.

Laboratórios 

 Os laboratórios estão distribuídos em 3 blocos de laboratórios e Bloco Didático A (laboratórios de informático).

O curso de Engenharia de Aquicultura utiliza um total de 25 laboratórios do campus, contemplando infraestrutura, equipamentos e materiais de consumo para desenvolvimento de aulas práticas, projetos de extensão e pesquisa nas diferentes áreas de conhecimento que abrangem a formação do bacharel em Engenharia de Aquicultura. Estes laboratórios são multiuso e de uso comum com outros cursos. 

• LABORATÓRIO DE LIMNOLOGIA E QUALIDADE DAS ÁGUAS; 
• LABORATÓRIO DE QUÍMICA ANALÍTICA;
  
• LABORATÓRIO DE QUÍMICA ORGÂNICA E FÍSICO-QUÍMICA; 
• LABORATÓRIO DE BIOQUÍMICA/GENÉTICA; 
• LABORATÓRIO DE ANÁLISE DE ALIMENTOS;
• LABORATÓRIO DE QUÍMICA GERAL; 
• SALA DE RAÇÃO;
• LABORATÓRIO DE NUTRIÇÃO DE ORGANISMOS AQUÁTICOS;
• LABORATÓRIO DE PISCICULTURA;
• LABORATÓRIO DE HIDROLOGIA E CLIMATOLOGIA; 
  
• LABORATÓRIO DE CLASSIFICAÇÃO E LEVANTAMENTO DO SOLO; 
  
• LABORATÓRIO DE FÍSICA DO SOLO;
  
• LABORATÓRIO DE QUÍMICA DO SOLO; 
• LABORATÓRIO DE ZOOLOGIA;
  
• MUSEU DE ZOOLOGIA;
• LABORATÓRIO DE EXPERIMENTAÇÃO ANIMAL;
  
• LABORATÓRIO DE FÍSICA-ÓPTICA; 
  
• LABORATÓRIO DE FÍSICA MECÂNICA;
  
• LABORATÓRIO DE HIDRÁULICA E IRRIGAÇÃO;
• LABORATÓRIO DE MICROBIOLOGIA; 
  
• LABORATÓRIO DE MICROSCOPIA; 
  
• LABORATÓRIO DE BOTÂNICA; 
  
• LABORATÓRIO DE INFORMÁTICA;
• LABORATÓRIO DE CARNES;
• LABORATÓRIO DE CIÊNCIAS HUMANAS I.

Estação de Aquicultura

Demais espaços e equipamentos utilizados para o desenvolvimento do curso  

• BLOCO DOCENTE ADMINISTRATIVO: local onde se encontram espaços de trabalho para docentes em tempo integral, bem como auditório;  
• BLOCO DIDÁTICO A: local onde se concentram as 16 salas de aulas teóricas disponíveis aos 10 cursos de graduação e 02 cursos de Pós-Graduação, assim como auditório,  02 salas destinadas para o estudo individual ou coletivo dos estudantes e  02 laboratórios de informática;   
• CENTRO VOCACIONAL TECNOLÓGICO (CVT);  
• GALPÃO AGROPECUÁRIO.